En la segunda fase, los estudiantes participaron en un proceso de formación en las áreas de lenguaje y matemáticas. Dicha formación se realizó los días 16 y 17 de octubre en los horarios de 8:00 a.m. a 5:00 p.m. en las instalaciones de la IED Normal Superior María Auxiliadora.
Después del proceso de formación que recibieron, 125 estudiantes presentaron la segunda prueba el 18 de octubre de 9:30 a 12:00 m, luego se realizó el respectivo proceso de calificación donde se definieron los nombres de los cinco mejores estudiantes de Santa Marta, quienes son los grandes finalistas de las Olimpiadas del Conocimiento Santa Marta 2014; y van a participar en la "Gran Final" la cual será transmitida en vivo y directo por el Canal Regional TeleCaribe el 28 de octubre de 4:30 a 6:00 de la tarde.
Los estudiantes finalistas son: Anderson Jesús Riquett Cormane, del grado 11, del IED, Normal Superior San Pedro Alejandrino, Juan Sebastián Vega Fandiño, del grado 11, del IED Alfonso López, Ana María Manjarres Gómez, de 11 grado, del IED Escuela Normal Superior María Auxiliadora, Daniela Margarita Rueda Barranco, grado 11 del IED Escuela Normal Superior María Auxiliadora y Jose Alberto Aguilar, de 11 grado y del IED Jesús Espeleta Fajardo.
El estudiante campeón de las Olimpiadas del Conocimiento Santa Marta 2014 tendrá como premio un cupo en la Magna Competencia Internacional de Operación Éxito en el mes de diciembre en San Juan de Puerto Rico, donde competirá con estudiantes de otros países por una bolsa en becas de hasta 100.000 dólares.